Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALS2Q96Q42 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms