Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TOX2Q96NM4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOX2Q96NM4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms