Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC43Q96MW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC43Q96MW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms