Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
YTHDC1Q96MU7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms