Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00477Q96M19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00477Q96M19 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms