Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms