Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms