Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDLIM2Q96JY6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms