Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms