Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EAF1Q96JC9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708.8 ms