Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK5RAP3Q96JB5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK5RAP3Q96JB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms