Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A14Q96JA4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A14Q96JA4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms