Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCED1BQ96HM7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCED1BQ96HM7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms