Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STAMBPL1Q96FJ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms