Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC10A4Q96EP9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC10A4Q96EP9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
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