Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms