Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTP4Q96DX8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms