Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms