Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CCDC74AQ96AQ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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