Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAVIN3Q969G5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms