Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRSF12Q8WXF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRSF12Q8WXF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms