Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TWIST2Q8WVJ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWIST2Q8WVJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms