Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSMCE1Q8WV22 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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