Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2AF1L4Q8WU68 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2AF1L4Q8WU68 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms