Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTR4

GDPD5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD5Q8WTR4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD5Q8WTR4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD5Q8WTR4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms