Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3RF3Q8TEJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3RF3Q8TEJ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms