Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTRT1Q8TDG2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTRT1Q8TDG2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms