Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms