Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA6DQ8NFY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms