Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYRIPQ8NFW9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms