Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAAF3Q8N9W5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms