Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHCHD4Q8N4Q1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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