Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCML4Q8N228 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms