Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC2Q8N158 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC2Q8N158 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms