Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms