Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC65Q8IXS2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC65Q8IXS2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms