Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC50Q8IVM0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC50Q8IVM0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms