Protein–RNA interactions for Protein: Q86Z20

CCDC125, Coiled-coil domain-containing protein 125, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC125Q86Z20 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC125Q86Z20 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC125Q86Z20 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC125Q86Z20 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms