Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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