Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU1Q7Z7A3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTU1Q7Z7A3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU1Q7Z7A3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms