Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE3BQ7Z3V4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3BQ7Z3V4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms