Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
STRCQ7RTU9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms