Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP2Q7RTS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP2Q7RTS6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms