Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTF1AQ7RTS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTF1AQ7RTS3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms