Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST3Q7LGC8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHST3Q7LGC8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHST3Q7LGC8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms