Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP31Q70CQ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP31Q70CQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
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