Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXIP1Q6ZW49 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXIP1Q6ZW49 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms