Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX8Q6ZV50 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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