Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CFAP47Q6ZTR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CFAP47Q6ZTR5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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