Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf47Q6ZRZ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms